MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycoplasma hyorhinis HUB-1 chromosome

Total Repeats: 25281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014448	TTA	2	6	7	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372806
2	NC_014448	A	7	7	43	49	100 %	0 %	0 %	0 %	304372806
3	NC_014448	ACT	2	6	61	66	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304372806
4	NC_014448	TTC	2	6	129	134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372806
5	NC_014448	AAC	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372806
6	NC_014448	TAAC	2	8	191	198	50 %	25 %	0 %	25 %	304372806
7	NC_014448	TAA	2	6	234	239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372806
8	NC_014448	TTC	2	6	312	317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372806
9	NC_014448	GAA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
10	NC_014448	CATT	2	8	390	397	25 %	50 %	0 %	25 %	304372806
11	NC_014448	ACA	2	6	409	414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372806
12	NC_014448	A	6	6	436	441	100 %	0 %	0 %	0 %	304372806
13	NC_014448	TAT	2	6	494	499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372806
14	NC_014448	TGA	2	6	501	506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372806
15	NC_014448	TAA	2	6	522	527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372806
16	NC_014448	CAA	2	6	533	538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372806
17	NC_014448	ATC	2	6	589	594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304372806
18	NC_014448	GGT	2	6	625	630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304372806
19	NC_014448	GAA	2	6	634	639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
20	NC_014448	TTA	2	6	644	649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372806
21	NC_014448	AGA	2	6	696	701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
22	NC_014448	T	6	6	702	707	0 %	100 %	0 %	0 %	304372806
23	NC_014448	T	6	6	777	782	0 %	100 %	0 %	0 %	304372806
24	NC_014448	A	6	6	793	798	100 %	0 %	0 %	0 %	304372806
25	NC_014448	T	7	7	838	844	0 %	100 %	0 %	0 %	304372806
26	NC_014448	AG	3	6	885	890	50 %	0 %	50 %	0 %	304372806
27	NC_014448	ATA	2	6	940	945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372806
28	NC_014448	GAA	2	6	946	951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
29	NC_014448	ATT	2	6	959	964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372806
30	NC_014448	AGA	2	6	978	983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
31	NC_014448	ATT	2	6	1114	1119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372806
32	NC_014448	CAA	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372806
33	NC_014448	GAAAGA	2	12	1146	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
34	NC_014448	A	6	6	1193	1198	100 %	0 %	0 %	0 %	304372806
35	NC_014448	CTT	2	6	1258	1263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014448	T	6	6	1262	1267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014448	GTT	2	6	1269	1274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014448	T	6	6	1273	1278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014448	TAT	3	9	1304	1312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014448	T	6	6	1315	1320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014448	ATAAA	2	10	1332	1341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014448	TAAT	2	8	1342	1349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014448	GAAAAA	2	12	1382	1393	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372807
44	NC_014448	GAAA	2	8	1409	1416	75 %	0 %	25 %	0 %	304372807
45	NC_014448	TTCAAA	2	12	1429	1440	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372807
46	NC_014448	AGG	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304372807
47	NC_014448	ATT	3	9	1462	1470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372807
48	NC_014448	AAG	2	6	1477	1482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372807
49	NC_014448	TTA	2	6	1577	1582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372807
50	NC_014448	A	6	6	1621	1626	100 %	0 %	0 %	0 %	304372807
51	NC_014448	ATTAA	2	10	1691	1700	60 %	40 %	0 %	0 %	304372807
52	NC_014448	ATG	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372807
53	NC_014448	TAA	2	6	1752	1757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372807
54	NC_014448	GCAA	2	8	1763	1770	50 %	0 %	25 %	25 %	304372807
55	NC_014448	A	6	6	1786	1791	100 %	0 %	0 %	0 %	304372807
56	NC_014448	TGCT	2	8	1801	1808	0 %	50 %	25 %	25 %	304372807
57	NC_014448	A	7	7	1833	1839	100 %	0 %	0 %	0 %	304372807
58	NC_014448	ATT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372807
59	NC_014448	TAT	2	6	1848	1853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372807
60	NC_014448	GTTTAA	2	12	1860	1871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372807
61	NC_014448	AGA	2	6	2002	2007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372807
62	NC_014448	AGA	2	6	2014	2019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372807
63	NC_014448	TGA	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372807
64	NC_014448	ACA	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372807
65	NC_014448	A	7	7	2128	2134	100 %	0 %	0 %	0 %	304372807
66	NC_014448	GAT	2	6	2135	2140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372807
67	NC_014448	ATT	2	6	2148	2153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372807
68	NC_014448	A	8	8	2163	2170	100 %	0 %	0 %	0 %	304372807
69	NC_014448	CAA	2	6	2196	2201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372807
70	NC_014448	TTC	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372807
71	NC_014448	AGA	2	6	2248	2253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372807
72	NC_014448	AAT	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372807
73	NC_014448	CAAAA	2	10	2302	2311	80 %	0 %	0 %	20 %	304372807
74	NC_014448	A	6	6	2308	2313	100 %	0 %	0 %	0 %	304372807
75	NC_014448	CAAT	2	8	2373	2380	50 %	25 %	0 %	25 %	304372807
76	NC_014448	T	6	6	2401	2406	0 %	100 %	0 %	0 %	304372807
77	NC_014448	TAA	2	6	2416	2421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372807
78	NC_014448	AAC	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372807
79	NC_014448	AAT	2	6	2500	2505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372808
80	NC_014448	A	8	8	2551	2558	100 %	0 %	0 %	0 %	304372808
81	NC_014448	T	6	6	2593	2598	0 %	100 %	0 %	0 %	304372808
82	NC_014448	A	6	6	2602	2607	100 %	0 %	0 %	0 %	304372808
83	NC_014448	AGA	2	6	2707	2712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372808
84	NC_014448	GA	3	6	2711	2716	50 %	0 %	50 %	0 %	304372808
85	NC_014448	A	6	6	2732	2737	100 %	0 %	0 %	0 %	304372809
86	NC_014448	T	6	6	2744	2749	0 %	100 %	0 %	0 %	304372809
87	NC_014448	TAG	3	9	2757	2765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372809
88	NC_014448	AAAC	2	8	2842	2849	75 %	0 %	0 %	25 %	304372809
89	NC_014448	TGG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304372809
90	NC_014448	TAA	2	6	2904	2909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372809
91	NC_014448	TGG	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304372809
92	NC_014448	CAG	2	6	3000	3005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304372809
93	NC_014448	AATT	2	8	3048	3055	50 %	50 %	0 %	0 %	304372809
94	NC_014448	AGA	2	6	3094	3099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372809
95	NC_014448	ATTT	2	8	3143	3150	25 %	75 %	0 %	0 %	304372809
96	NC_014448	GATT	2	8	3162	3169	25 %	50 %	25 %	0 %	304372809
97	NC_014448	ATT	2	6	3185	3190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372809
98	NC_014448	ACA	2	6	3191	3196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372809
99	NC_014448	GAA	2	6	3230	3235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372809
100	NC_014448	TTC	2	6	3412	3417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372809
101	NC_014448	A	6	6	3437	3442	100 %	0 %	0 %	0 %	304372809
102	NC_014448	T	6	6	3454	3459	0 %	100 %	0 %	0 %	304372809
103	NC_014448	GAA	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372809
104	NC_014448	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372809
105	NC_014448	AAAG	2	8	3596	3603	75 %	0 %	25 %	0 %	304372809
106	NC_014448	T	7	7	3612	3618	0 %	100 %	0 %	0 %	304372809
107	NC_014448	AAG	2	6	3790	3795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372809
108	NC_014448	A	6	6	3806	3811	100 %	0 %	0 %	0 %	304372809
109	NC_014448	T	6	6	3824	3829	0 %	100 %	0 %	0 %	304372809
110	NC_014448	AATG	2	8	3838	3845	50 %	25 %	25 %	0 %	304372809
111	NC_014448	GAA	2	6	3860	3865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372809
112	NC_014448	GCA	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304372809
113	NC_014448	TAG	2	6	3882	3887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372809
114	NC_014448	AAAAG	2	10	3901	3910	80 %	0 %	20 %	0 %	304372809
115	NC_014448	AGA	2	6	3920	3925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372809
116	NC_014448	TGA	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372809
117	NC_014448	A	7	7	4085	4091	100 %	0 %	0 %	0 %	304372809
118	NC_014448	A	6	6	4119	4124	100 %	0 %	0 %	0 %	304372809
119	NC_014448	GATA	2	8	4156	4163	50 %	25 %	25 %	0 %	304372809
120	NC_014448	GAAA	2	8	4203	4210	75 %	0 %	25 %	0 %	304372809
121	NC_014448	AAGT	2	8	4215	4222	50 %	25 %	25 %	0 %	304372809
122	NC_014448	AATT	2	8	4242	4249	50 %	50 %	0 %	0 %	304372809
123	NC_014448	AT	3	6	4333	4338	50 %	50 %	0 %	0 %	304372809
124	NC_014448	ATG	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372809
125	NC_014448	A	6	6	4362	4367	100 %	0 %	0 %	0 %	304372809
126	NC_014448	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	304372809
127	NC_014448	TCTT	2	8	4426	4433	0 %	75 %	0 %	25 %	304372809
128	NC_014448	TGA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372809
129	NC_014448	CTG	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304372809
130	NC_014448	TTTA	2	8	4533	4540	25 %	75 %	0 %	0 %	304372809
131	NC_014448	ATT	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372810
132	NC_014448	TAA	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372810
133	NC_014448	TGA	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372810
134	NC_014448	AGA	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372810
135	NC_014448	GAA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372810
136	NC_014448	GAATT	2	10	4661	4670	40 %	40 %	20 %	0 %	304372810
137	NC_014448	TAG	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372810
138	NC_014448	ATT	2	6	4690	4695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372810
139	NC_014448	A	6	6	4705	4710	100 %	0 %	0 %	0 %	304372810
140	NC_014448	AAG	2	6	4729	4734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372810
141	NC_014448	ATT	2	6	4753	4758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372810
142	NC_014448	A	6	6	4770	4775	100 %	0 %	0 %	0 %	304372810
143	NC_014448	TAA	2	6	4865	4870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372810
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145	NC_014448	AACT	2	8	4946	4953	50 %	25 %	0 %	25 %	304372810
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148	NC_014448	ATAA	2	8	5033	5040	75 %	25 %	0 %	0 %	304372810
149	NC_014448	A	7	7	5070	5076	100 %	0 %	0 %	0 %	304372811
150	NC_014448	TAT	2	6	5087	5092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372811
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168	NC_014448	TGA	2	6	5501	5506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372811
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175	NC_014448	TTAT	2	8	5719	5726	25 %	75 %	0 %	0 %	304372811
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185	NC_014448	A	6	6	5967	5972	100 %	0 %	0 %	0 %	304372811
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